独立核算是指企业或者单位单独作为一个会计核算主体，核算单位的收入支出，各项税费等，自负盈亏是指单位自己负担自己单位的盈亏，如果有盈利，单位可以自己决定留存或者分配方式，如果亏损，也自行承担。比如分公司就是不独立核算，不自负盈亏的单位，而子公司则是独立核算，自负盈亏的单位。